應用化學專業（中外合作）于2003年設置，為全日制本科，學制4年，授予理學學士。本專業為上海應用技術大學與新西蘭奧克蘭理工大學（Auckland University of Technology）合作辦學項目，培養具有堅實英語基礎，掌握分析檢測和質量監控專業基本知識，具備較強分析實驗技能及分析研究的能力，在國內外化工、醫藥、食品、環保及其相關領域從事分析檢測、質量監控、分析技術應用和質量認證管理等工作的國際化應用技術型人才。本合作辦學項目學生在兩校所得學分互認，學生按照學校規定修滿中方課程和學分，可獲得中方本科畢業證書和理學學士學位證書。修滿中、外方課程的學分，可同時獲得奧克蘭理工大學理學學士學位證書。本專業按國家統招計劃招生，年招生人數80人/批，現有在校學生300人，近三年畢業學生就業率達到100%，中外雙學位率達到85%以上。

本專業合作辦學項目依托奧克蘭理工大學應用科學學院，是奧克蘭理工大學中最具影響力的院系之一。作為中國和新西蘭高校第一個共同管理的本科層次的理工科類合作項目，本專業充分利用國內外優質教學資源，建立了中外雙校園“3+1”培養模式，學生既可以在國內完成四年學業，也可以在第四學年赴境外學習完成全部學業。四年中的專業課程由中外雙方共同設計制定，引入奧克蘭理工大學的專業核心課14門，AUT承擔三分之一主干課程的教學任務，課程設置體現科學性、前瞻性和整體優化。其中雙方合作的《配位化學實驗》獲批學校高水平國際交流課程建設項目。專業培養中加強分析理論基礎、專業技術和實踐創新，同時注重外語的培養，大力開展雙語和全英語教學、促進學生外語應用能力的提高，已形成了以培養“卓越一線工程師”為目標，適應全球化發展需求的國際化、復合型高層次應用性人才的教學培養體系。

應用化學教學團隊為上海市教學團隊，本專業（中外合作）在編專任教師19人，實驗教師5名。作為中外合作辦學項目，應用化學專業（中外合作）配備了6名奧克蘭理工大學外籍教師，其中教授2名，副教授1名，對本專業方向學生進行全英文專業課程授課。

本專業具有完善的實驗和實踐訓練教學場所、齊全的教學科研儀器設備，重視學生實踐能力的培養。本專業分析化學實驗室所在的基礎化學實驗中心是上海市首批市級實驗教學示范中心。本專業建立“校企合作”、“產學研一體化”的培養機制，建立高校、企業的“產業實訓基地”，引導高校和企業資源共享，已與上海石化、上海天美分析儀器有限公司等企事業單位建立專業實踐基地，保障學生的校外實踐教學。

本項目立足培養具有終生學習和繼續教育意識，發展學生創新創造能力。所培養的學生連年在全國大學生英語競賽中獲獎，截止目前，已有60余位同分別學榮獲全國特等獎、一等獎和二等獎。近5年來有20余名同學榮獲上海市優秀畢業生稱號，15名同學榮獲上海應用技術大學優秀畢業生稱號，每年均有同學獲國家獎學金、上海市獎學金、國家勵志獎學金和上海市化學化工學會獎學金等殊榮，多名同學的本科畢業論文榮獲上海市化學化工類本科畢業生優秀論文一等獎和二等獎。多名同學在“挑戰杯”課外技能大賽、全國大學生化學實驗競賽、上海市寒暑假大學生社會實踐、上海市科技創新創業作品比賽等活動收獲了多項榮譽。