貴州醫科大學前身為1938年建立的“國立貴陽醫學院”，是當時全國最早直屬國家教育部的9所高等醫學院校之一，首任院長是來自北京協和醫學院的中國早期熱帶病學專家、醫學教育家李宗恩教授，在他的帶領下，楊崇瑞、朱章賡、湯佩松、賈魁、楊濟時、劉維德、洪謙、林紹文、侯寶璋、張孝騫、郭秉寬、王季午、朱懋根、李瑞麟、李漪、王志均等大批學術造詣精湛的國內知名專家學者云集國立貴陽醫學院，使其被譽為當時的“小協和”，開創了貴州高等教育之先河。

1950年“國立貴陽醫學院”更名為“貴陽醫學院”并劃歸貴州省人民政府管理，1965年將“貴陽醫學院中醫系”劃離另行組建“貴陽中醫學院”；1981年成為全國第一批碩士學位授予單位；2003年，成為博士學位授予單位；2015年4月更名為“貴州醫科大學”，是蘇州大學、中國醫學科學院北京協和醫學院對口支援高校。

學校占地面積3278畝，直屬附屬醫院4所，非直屬附屬醫院8所，教學醫院12所，非臨床專業實踐教學基地134個。擁有多個科研平臺和創新團隊，其中省部共建國家重點實驗室等國家級平臺9個，省部級平臺58個。

學校現有教學單位21個，本科專業47個。博士學位授權點4個，其中一級學科博士學位授權點3個（基礎醫學、公共衛生與預防醫學、藥學），專業學位類別博士學位授權點1個（臨床醫學）。碩士學位授權點18個，其中一級學科碩士學位授權點10個，專業學位類別碩士學位授權點8個。自主設置交叉學科博士學位授權點1個（分子醫學）、碩士學位授權點1個（智能醫學）。貴州省國內一流建設學科I類學科群1個，貴州省一流學科5個，貴州省特色重點學科一級學科4個，貴州省重點學科一級學科2個；國家臨床重點專科建設項目6個，博士后科研流動站3個。臨床醫學、藥理學與毒理學進入ESI全球前1%。國家級一流專業建設點10個，省級一流專業建設點20個。2019年，在中國醫學科學院北京協和醫學院支持下開辦臨床醫學教育改革創新班——“協和班”，在貴州省率先舉辦臨床醫學精英班。